TACGENE

Crédits

@tacgene

Personnes Impliquées

Contact: tacgene[at]mnhn.fr

Présentation

TACGENE a été créée en 2011 au sein de l’U1154–UMR7196, pour faciliter l'accès des laboratoires académiques aux techniques d’édition du génome et bénéficie d’un label IBiSA  depuis 2016.

Soutenu dans le cadre du programme Investissement d’Avenir - Infrastructures Nationales en Biologie Santé, nous avons développé une solide expertise dans le design, la production et l’utilisation des technologies TALEN (Transcription-Activated like Effector Nucleases), puis CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)/Cas9. Nous les utilisons dans des cellules en culture dans nos projets de recherche et en collaboration, dans de nombreux organismes modèles, en particulier le rat, la souris et le poisson-zèbre au travers du réseau Celphedia.

Les activités de recherche et de développement que nous menons dans l'équipe GE2R  pour améliorer ces technologies, en parallèle aux activités de service de TACGENE, nous permettent de proposer aujourd’hui des solutions et une expertise avancée sur les différentes problématiques d’édition du génome (Knock-out, Knock-In…).

Nucléases développées par TACGENE

Crédits

©C.Giovannangeli

Expertises et services proposés

• Design d’une stratégie d'édition du génome en fonction du projet
• Design et sélection des sgRNAs
• Conseils d'utilisation et aide au génotypage
• Mise à disposition de protocoles sur demande
• Production de Cas9 et variants (ARNm et protéines recombinantes)
• Transcription des sgRNAs/pegRNAs et contrôle qualité
• Production d’ADN donneurs
• Tests d'activité in vitro des complexes sgARN/Cas9 purifiés
• Transfections et tests d'activité en cellules
• Clonage cellulaire de lignées éditées

Exemples de Publications récentes impliquant les activités de TACGENE

• De Oliveira VC, Gomes Mariano Junior C, Belizário JE, Krieger JE, Fernandes Bressan F, Roballo KCS, Fantinato-Neto P, Meirelles FV, Chiaratti MR, Concordet JP, Ambrósio CE. Characterization of post-edited cells modified in the TFAM gene by CRISPR/Cas9 technology in the bovine model. PLoS One. 2020 Jul 10;15(7):e0235856. doi: 10.1371/journal.pone.0235856. eCollection 2020.
• Joubert R, Mariot V, Charpentier M, Concordet JP, Dumonceaux J. Gene Editing Targeting the DUX4 Polyadenylation Signal: A Therapy for FSHD?  J Pers Med. 2020 Dec 23;11(1):7. doi: 10.3390/jpm11010007.
• Pavani G, Fabiano A, Laurent M, Amor F, Cantelli E, Chalumeau A, Maule G, Tachtsidi A, Concordet JP, Cereseto A, Mavilio F, Ferrari G, Miccio A, Amendola M. Correction of β-thalassemia by CRISPR/Cas9 editing of the α-globin locus in human hematopoietic stem cells. Blood Adv. 2021 Mar 9;5(5):1137-1153. doi: 10.1182/bloodadvances.2020001996.
• Rosello M, Vougny J, Czarny F, Mione MC, Concordet JP, Albadri S, Del Bene F. Precise base editing for the in vivo study of developmental signaling and human pathologies in zebrafish. Elife. 2021 Feb 12;10:e65552. doi: 10.7554/eLife.65552.

Principales Collaborations

• Erika Brunet, Imagine/Inserm-CNRS, Paris (Translocations Chromosomiques)
• Ignacio Anegon, ITUN - UMR1064,, Nantes (Transgenèse Rat)
• Filippo Del Bene, Institut de la Vision/Inserm, Paris (Ciblage génomique Zebrafish)
• Pierre Affaticati, TEFOR CoreFacility/CNRS, Gif-sur-Yvette (Transgenèse Zebrafish)
• Kristof Jagla,Fly-facility/Inserm-CNRS, Clermont-Ferrand (Transgenèse Drosophile)
• Geneviève Tavernier, Anexplo/Inserm-CNRS, Toulouse (Transgenèse Souris)
• Hervé Totsivint, Barbara Demeneix, Phyma MNHN/CNRS (ciblage génomique Xénope)
• Emmanuelle Jacquin-Joly, INRA Versailles (Ciblage génomique dans Lepidoptera)
• Tsuyoshi Momose, SU-CNRS, Villefranche s/ Mer (Ciblage génomique dans Clytia)

logos Inserm Tefor Celphedia

Crédits

©Inserm_Tefor_Celphedia